Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcf2Q99LE6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf2Q99LE6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf2Q99LE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf2Q99LE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms