Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gps1Q99LD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gps1Q99LD4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gps1Q99LD4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gps1Q99LD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gps1Q99LD4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms