Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsl24d1Q99L28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsl24d1Q99L28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsl24d1Q99L28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsl24d1Q99L28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms