Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ciao1Q99KN2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ciao1Q99KN2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ciao1Q99KN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ciao1Q99KN2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ciao1Q99KN2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ciao1Q99KN2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms