Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2aQ99KJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2aQ99KJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms