Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp8Q924X6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrp8Q924X6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrp8Q924X6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrp8Q924X6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrp8Q924X6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms