Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Clip1Q922J3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Clip1Q922J3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Clip1Q922J3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Clip1Q922J3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Clip1Q922J3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Clip1Q922J3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Clip1Q922J3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Clip1Q922J3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Clip1Q922J3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms