Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3Q920N1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Odf3Q920N1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf3Q920N1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf3Q920N1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf3Q920N1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms