Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZY2

Hrh4, Histamine H4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh4Q91ZY2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hrh4Q91ZY2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hrh4Q91ZY2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hrh4Q91ZY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hrh4Q91ZY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms