Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6cQ91ZQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pde6cQ91ZQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde6cQ91ZQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pde6cQ91ZQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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