Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc65Q8VHI7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc65Q8VHI7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc65Q8VHI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc65Q8VHI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms