Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmcd1Q8VEE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmcd1Q8VEE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmcd1Q8VEE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmcd1Q8VEE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmcd1Q8VEE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmcd1Q8VEE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmcd1Q8VEE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmcd1Q8VEE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmcd1Q8VEE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms