Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg8Q8VE18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg8Q8VE18 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smg8Q8VE18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg8Q8VE18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg8Q8VE18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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