Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rprd1aQ8VDS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rprd1aQ8VDS4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rprd1aQ8VDS4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rprd1aQ8VDS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms