Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cbx7Q8VDS3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cbx7Q8VDS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cbx7Q8VDS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx7Q8VDS3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx7Q8VDS3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms