Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TgdsQ8VDR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TgdsQ8VDR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms