Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8VDP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8VDP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8VDP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8VDP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8VDP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8VDP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8VDP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q8VDP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8VDP2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms