Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc16Q8R349 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc16Q8R349 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc16Q8R349 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc16Q8R349 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms