Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CipcQ8R0W1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CipcQ8R0W1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CipcQ8R0W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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