Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Txndc11Q8K2W3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Txndc11Q8K2W3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Txndc11Q8K2W3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Txndc11Q8K2W3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms