Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim68Q8K243 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim68Q8K243 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim68Q8K243 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim68Q8K243 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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