Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S3

Unc5b, Netrin receptor UNC5B, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5bQ8K1S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Unc5bQ8K1S3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Unc5bQ8K1S3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Unc5bQ8K1S3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Unc5bQ8K1S3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Unc5bQ8K1S3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms