Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rbm17Q8JZX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rbm17Q8JZX4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rbm17Q8JZX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rbm17Q8JZX4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rbm17Q8JZX4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms