Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim61Q8JZK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim61Q8JZK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim61Q8JZK6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim61Q8JZK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim61Q8JZK6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms