Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tshz3Q8CGV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tshz3Q8CGV9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tshz3Q8CGV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tshz3Q8CGV9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tshz3Q8CGV9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tshz3Q8CGV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms