Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upp2Q8CGR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp2Q8CGR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upp2Q8CGR7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Upp2Q8CGR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms