Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc8Q8CFD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ercc8Q8CFD5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ercc8Q8CFD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc8Q8CFD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc8Q8CFD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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