Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp27Q8CEG8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp27Q8CEG8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp27Q8CEG8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp27Q8CEG8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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