Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDY9

Pcdhb7, Protocadherin beta 7, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb7Q8CDY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb7Q8CDY9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb7Q8CDY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb7Q8CDY9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb7Q8CDY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms