Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsun3Q8CCT7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsun3Q8CCT7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nsun3Q8CCT7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Nsun3Q8CCT7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nsun3Q8CCT7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nsun3Q8CCT7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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