Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8CC96 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8CC96 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8CC96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8CC96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8CC96 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8CC96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8CC96 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8CC96 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8CC96 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8CC96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8CC96 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8CC96 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8CC96 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8CC96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8CC96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8CC96 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8CC96 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8CC96 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8CC96 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8CC96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8CC96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8CC96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8CC96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8CC96 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8CC96 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8CC96 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8CC96 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8CC96 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8CC96 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8CC96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8CC96 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8CC96 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8CC96 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8CC96 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8CC96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8CC96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8CC96 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8CC96 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8CC96 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8CC96 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8CC96 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8CC96 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8CC96 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8CC96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8CC96 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8CC96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8CC96 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8CC96 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8CC96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8CC96 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8CC96 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8CC96 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8CC96 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8CC96 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CC96 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CC96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CC96 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8CC96 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CC96 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CC96 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8CC96 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8CC96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8CC96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8CC96 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8CC96 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8CC96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CC96 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CC96 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CC96 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8CC96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8CC96 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CC96 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8CC96 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms