Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp11Q8CB67 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrp11Q8CB67 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp11Q8CB67 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp11Q8CB67 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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