Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc15Q8C9M2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc15Q8C9M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc15Q8C9M2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc15Q8C9M2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc15Q8C9M2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms