Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933409G03RikQ8C5U0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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4933409G03RikQ8C5U0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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4933409G03RikQ8C5U0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4933409G03RikQ8C5U0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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4933409G03RikQ8C5U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4933409G03RikQ8C5U0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4933409G03RikQ8C5U0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
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