Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx16Q8C080 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx16Q8C080 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx16Q8C080 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms