Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ubr7Q8BU04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ubr7Q8BU04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubr7Q8BU04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubr7Q8BU04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubr7Q8BU04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubr7Q8BU04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubr7Q8BU04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubr7Q8BU04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubr7Q8BU04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms