Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gbp9Q8BTS3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gbp9Q8BTS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gbp9Q8BTS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms