Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tyw3Q8BSA9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tyw3Q8BSA9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tyw3Q8BSA9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tyw3Q8BSA9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tyw3Q8BSA9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.7 ms