Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cc2d1bQ8BRN9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cc2d1bQ8BRN9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cc2d1bQ8BRN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms