Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp4f39Q8BGU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms