Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smndc1Q8BGT7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smndc1Q8BGT7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smndc1Q8BGT7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smndc1Q8BGT7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smndc1Q8BGT7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms