Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krr1Q8BGA5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krr1Q8BGA5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krr1Q8BGA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krr1Q8BGA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms