Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc4Q8BG19 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmtc4Q8BG19 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc4Q8BG19 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms