Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms