Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc27Q80YS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc27Q80YS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc27Q80YS5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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