Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chn2Q80XD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chn2Q80XD1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chn2Q80XD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chn2Q80XD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chn2Q80XD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chn2Q80XD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms