Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pnma8aQ80VM8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnma8aQ80VM8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnma8aQ80VM8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnma8aQ80VM8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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