Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vat1lQ80TB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vat1lQ80TB8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vat1lQ80TB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vat1lQ80TB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vat1lQ80TB8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vat1lQ80TB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vat1lQ80TB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vat1lQ80TB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms