Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh8Q7TSK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdh8Q7TSK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdh8Q7TSK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdh8Q7TSK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms