Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dsg1cQ7TSF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dsg1cQ7TSF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1cQ7TSF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms